Ressources génétiques et innovation variétale chez le pin maritime

Ressources génétiques et innovation variétale chez le pin maritime
19.112020
DateProjet terminé
Depuis l’initiation du programme d’amélioration génétique chez le pin maritime dès les années 1960, de nombreuses variétés améliorées notamment pour leur croissance et leur rectitude ont été développées. Au cours des différents cycles de sélection, des erreurs d’identité d’arbres ont été accumulées entrainant une imprécision sur les valeurs génétiques des individus et donc une diminution du gain génétique potentiel dans les variétés améliorées.

Le projet est constitué de 2 volets. Le volet 1 (auquel FCBA a contribué) a pour objectif d’assurer la traçabilité de l’ensemble des individus de la population d’amélioration. 6407 arbres issus des populations d’amélioration landaises G0 et G1 ont été vérifiés soit 373 génotypes G0 et 1064 génotypes G1 à raison de 3 à 15 copies par génotype. 62 SNPs sur les 80 testés ont été retenus. Dans un premier temps, l’unicité entre génotype et profil moléculaire a été vérifiée pour chaque arbre. Après correction des erreurs d’adéquation profil moléculaire/génotype, nous avons identifié 366 profils moléculaires uniques pour les G0 et 1061 pour les G1. Dans un second temps, l’identité du père et de la mère (le pedigree) de chaque G1 a été vérifiée. Dans 86 % des cas, aucune erreur n’a été observée. Pour 9 % des G1, l’un au moins des parents était faux. Enfin, pour 5 % des G1, le pedigree n’a pu être vérifié car le parent G0 n’est plus disponible. Ces ressources génétiques certifiées permettront de développer de nouvelles stratégies de sélection basées sur le marquage moléculaire. Ces stratégies innovantes permettront de créer des variétés mieux adaptées aux évolutions environnementales (changement climatique, arrivée de nouveaux pathogènes,…) et économiques (volet 2 développé par INRAE).

Coordinateur :
Laurent Bouffier (INRAE)

Partenaire :
INRAE

Projet financé par :
DRAAF Nouvelle-Aquitaine